Kakashi cerca di redimere Obito, il quale non cede e decide, quindi, di affrontare l'ex-compagno per difenderne gli ideali che aveva un tempo. La Decacoda, intanto, si risveglia e le si legano Madara e Obito per controllarla. Il suo potere è così grande che nemmeno Kurama e Gyuki riescono a tenerle testa. Arrivano, però, tutti gli altri ninja dell'Alleanza in soccorso alle forze portanti. Dal Quartier Generale arrivano indicazioni su come bloccare la Decacoda per concentrarsi così sul suo "cervello": i due Uchiha che la comandano. Il piano fallisce e la Decacoda, dopo essersi trasformata, bombarda il Quartier Generale, il "cervello" dell'esercito alleato. Prima di esser colpiti, Shikaku ed Inoichi mandano l'ultimo piano, che consiste nel proteggere Naruto finché non ricrea il chakra che passerà poi a tutti i ninja rimasti. Nel tentativo di proteggerlo, Neji viene colpito e muore. Naruto rimane scioccato da tale evento, ma grazie al sostegno di Hinata riesce a ritrovare la voglia di combattere. Rafforzata dal chakra della Volpe, l'Alleanza riesce a spezzare il legame tra gli Uchiha e la Decacoda. Intanto, presso il Villaggio della Foglia, Orochimaru conduce Sasuke, Jugo e Suigetsu alla loro meta.