Carrot viene nominata nuova sovrana del ducato di Mokomo, poiché Cane-tempesta e Gatto-vipera decidono di restare come vassalli di Momonosuke e i pirati della peggiore generazione lasciano Wa, mentre Yamato decide di restare ad aiutare Momonosuke a difendere il paese dalle possibili invasioni. L'equipaggio scopre le sue nuove taglie; intanto, Crocodile e Drakul Mihawk decidono di usare Bagy come capo fantoccio del loro nuovo gruppo, l'organizzazione Cross Guild, nata come gruppo di cacciatori di marines. Amazon Lily viene attaccata dalla Marina, che schiera dei nuovi modelli di Pacifista chiamati Seraphim, e dai pirati di Barbanera: l'invasione viene interrotta da Rayleigh e Shakky, ma la ciurma dell'imperatore riesce a rapire Kobi. Sabo nel mentre tenta di informare l'Armata rivoluzionaria di non essere responsabile della morte di Cobra e che qualcuno è seduto sul Trono vuoto, ma la sua posizione viene distrutta. Salpati da Wa, Rufy e la ciurma incontrano una ragazza in una tempesta di neve, che si scopre essere Bonney, e vengono attaccati da uno squalo meccanizzato. Dopo essere fuggiti, arrivano all'isola di Egghead e vengono salvati da una ragazza che afferma di essere il dottor Vegapunk, spiegando che l'isola è la sede della divisione scientifica del Governo. Rufy, Jinbe, Chopper e la stessa Bonney sbarcano sull'isola, scoprendo un parco a tema pieno di giostre olografiche: qui incontrano una ragazzina gigante, che sostiene anch'essa di essere lo scienziato. Bonney spiega la sua intenzione di trovare Vegapunk per chiedergli le motivazioni che lo hanno spinto a trasformare suo padre, ossia Orso Bartholomew, in un'arma priva di umanità; nel mentre Lucci, Kaku e Stussy, dopo essere stati incaricati di uccidere lo scienziato, discutono su come questi abbia diviso la sua personalità in sei cloni: Shaka, Lilith, Edison, Pythagoras, Atlas e York. Intanto, mentre Zoro e Brook restano a guardia della nave, il resto dell'equipaggio entra nel laboratorio di Vegapunk accompagnato da Lilith, venendo attaccati da un Seraphim somigliante a Jinbe. Shaka entra in contatto con Dragon, dicendo che Vegapunk è in pericolo di vita, per poi fermare il Seraphim e spiegare a Sanji, Nami, Usop, Franky e Robin che la tecnologia di Egghead si basa su quella dell'antico regno. Altrove, i pirati di Barbanera attaccano i pirati Heart, tentando di rubare le loro copie dei Road Poignee Griffe.