Con i più alti tassi di comparsa di kaiju al mondo, il Giappone deve difendersi dall'attacco di mostri mortali. Hibino Kafka entra nella Japan Defense Force, un'organizzazione militare incaricata di neutralizzare i kaiju. Hibino ha sempre sognato di unirsi alla forza e vorrebbe realizzare il suo sogno d'infanzia di eliminare il kaiju. Improvvisamente sarà proprio lui a trasformarsi in un kaiju. Hibino Kafka spera di mantenere il patto con la sua amica d'infanzia Mina Ashiro per unirsi alla Japan Defense Force. Riesce a superare le prove di ammissione, Kafka ha una possibilità in più per realizzare il suo sogno. C'è solo un problema: improvvisamente si è trasformato in un kaiju! E ancora peggio, è stato inserito nella lista di neutralizzazione della Defense Force con il nome in codice Kaiju No. 8.