Conan, Ai e i Detective Boys rimangono rinchiusi nella cella frigorifera di un furgone insieme al corpo di un uomo, ucciso da uno dei camionisti. Conan cerca di far arrivare un messaggio in codice ad Amuro perché venga a salvarli. Temendo che quest'ultimo non l'abbia trovato, ne invia un altro a Subaru Okiya. Entrambi contribuiscono a salvarli, ma, mentre Amuro non è al corrente dell'intervento di Okiya, quest'ultimo sembra osservare quello di Amuro dalla finestra. Nonostante Amuro abbia trovato il messaggio in codice, dice ai bambini che non l'ha trovato e che passava di lì per caso, e subito dopo riesce a capire qual è la casa del dottor Agasa. Nel caso successivo, Conan vuole fare una domanda a Sera di nascosto, ma viene interrotto. Nota poi che quando la ragazza sorride, le spunta un canino, e questo gli conferma i suoi sospetti di averla già vista da qualche parte. Quando Sera si allontana correndo, Ran ha sempre l'impressione di sentire il rumore delle onde. Conan riesce poi a farle la domanda, chiedendole proprio se l'ha già vista, ma lei sorride e risponde che non lo sa, pensando fra sé e sé che non può rivelarglielo finché non arriverà il momento. Conan, Ai, i Detective Boys e le agenti Yumi Miyamoto e Naeko Miike incontrano poi sul luogo di un delitto l'ex fidanzato di Yumi, Shukichi Haneda, un giovane giocatore di shōgi con gli occhiali rotondi e un po' di barba che sembra avere buone capacità deduttive. Conan chiede a Jodie di incontrarlo in un parco e lì la informa della verità sul falso Akai e su Bourbon, chiedendole di far indagare l'FBI sul motivo per cui quest'ultimo si trattiene al caffè Poirot. Un uomo preso in ostaggio nella rapina in cui è stato visto per la prima volta il falso Akai incontra per caso Jodie, e le dice di aver visto l'uomo con la cicatrice pochi giorni prima. Dopo che Jodie afferma che ad Akai piace il caffè in lattina, Ai ha l'impressione che assomigli a una persona che conosceva e lo dice a Conan.