All'Ospedale Centrale di Haido Conan e Kogoro incontrano Amuro, il quale afferma di essere venuto a trovare un conoscente di nome Rikumichi Kusuda e chiede a Conan se lo conosce. La sua risposta è negativa, ma Amuro nota che Conan ha risposto senza esitazione, come se soltanto dal nome avesse capito di chi stava parlando. Amuro racconta anche che da piccolo è stato soprannominato "Zero" perché il suo nome di battesimo si scrive con l'ideogramma di "trasparente". Conan si chiede "Possibile che lui sia...". Amuro ricorda che quando era piccolo una donna gli disse addio, spiegando di dover andare lontano e chiamandolo "Rei". Conan si rivolge poi a lui chiamandolo "Zero". Amuro chiede anche a Takagi se ricorda di un uomo di nome Rikumichi Kusuda, e l'agente gli risponde che è stata trovata un'auto danneggiata il cui proprietario si chiama così, con all'interno schizzi di sangue anche molto piccoli, che Amuro pensa derivino da un colpo di pistola. Jodie parla poi per telefono con un'amica, un'insegnante di scuola elementare che le insegnò il giapponese. In seguito Amuro parla di questa donna con Vermouth, affermando che lo aiuterà a trovare "l'ultimo tassello". Successivamente Ai si accorge che Conan sta per salire sull'auto degli agenti dell'FBI e pensa che sia successo qualcosa "fuori dal suo territorio". Sull'auto Conan informa Jodie che Amuro sta indagando su Rikumichi Kusuda e le chiede di non far trapelare la notizia che si è suicidato. Le sta per dire anche un'altra cosa su Amuro, ma viene interrotto da una telefonata ricevuta da Jodie, che la informa che l'amica è in ospedale perché spinta giù da una rampa di scale. Sul luogo delle indagini si presenta anche Amuro, affermando di essere stato assunto dall'insegnante per proteggerla da uno stalker. Amuro incontra Jodie e Camel ed è informato da Takagi che sono agenti dell'FBI. Jodie ricorda a Camel che non devono fargli capire che l'FBI sospetta di lui. Mentre cercano di risolvere il caso, Amuro afferma che solo lui e Conan, ma non gli agenti dell'FBI, hanno capito qualcosa, perché si è accorto che Conan ha iniziato a lanciare occhiate verso il colpevole. Il ragazzo chiede agli agenti dell'FBI con fare supponente di andare via dal "suo Giappone". Conan gli chiede all'orecchio se è un "nemico dei cattivi", chiamandolo di nuovo "Zero", e lui risponde che teme che Conan si sbagli di grosso sul suo conto. Conan ripensa a diversi atteggiamenti di Amuro e sospetta che sia un agente di polizia segreta, appartenente all'ufficio di pubblica sicurezza giapponese (soprannominato appunto "Zero") dell'agenzia nazionale di polizia (NPA, National Police Agency), il cui organo di Tokyo è il PSB (Public Security Bureau). Se fosse così, non avrebbe motivo di aver paura di lui. Conan pensa anche che Amuro stia cercando di arrivare a un'informazione essenziale che gli manca. Jodie e Camel si recano all'ospedale perché informati che le condizioni dell'amica di Jodie sono peggiorate, e Amuro li segue dicendo che lo fa perché è una sua cliente. Quando Jodie lascia Amuro e Camel da soli, scoprendo che in realtà l'amica sta bene, il primo chiede informazioni su Rikumichi Kusuda, ma Camel nega di conoscerlo. Jodie chiede a Camel se ha parlato di Kusuda ad Amuro e lui risponde che non gli direbbe mai che Kusuda si è suicidato; dopodiché Jodie scompare.