Intrappolato nel lontano futuro, il team ThunderCats Lost è alla disperata ricerca di un modo per tornare al passato e impedire la guerra che potrebbe significare la fine per tutto il genere del gatto. Ma con le forze oscure schierate contro di loro che guadagnano forza ogni giorno, i Thunderan assediati della Sesta Terra stanno cominciando a soccombere sotto la pressione sempre crescente. Mentre Neko colpisce da sola nel tentativo di abbattere i loro nemici, i suoi compagni di squadra pianificano un ultimo raid per assicurarsi il Thundrillium di cui hanno bisogno per alimentare il loro viaggio nel tempo. Ma all'insaputa di loro, dietro i loro enigmatici attaccanti si profila una minaccia ancora più grande - una forza diversa da qualsiasi cosa abbiano mai affrontato prima!