Yugi e Kaiba si preparano a duellare in un'arena che riproduce il Colosseo. Nell'ultimo scontro tra le loro Divinità Egizie, che si stanno distruggendo a vicenda, gli avversari vengono investiti da una luce abbagliante, mentre il Millennium Puzzle e la Millennium Rod di Malik, spettatore, reagiscono; gli oggetti del Millennio permettono a Seto e all'altro Yugi di avere una visione: i ragazzi vengono trasportati nell'antico Egitto, devastato dalle tenebre, provenienti dal palazzo del Faraone, il quale, sfidato, si accinge a combattere contro lo stregone malvagio rappresentato anche nella tavola che Kaiba vide durante la mostra egizia, al museo. Nessuno sa come lo scontro terminò. Yugi riesce a sconfiggere Kaiba, ottenendo "Obelisco del tiranno" e l'accesso alla finale contro Marik.