Accompagnato da Jinn e Kleene, l'equipaggio della Edens Zero attraversa Dragonfall attraverso una breccia lasciata dalla Edens One e arriva nel Cosmo Aoi. Seguendo le informazioni che Hermit recupera dai registri cancellati della nave, l'equipaggio atterra sul pianeta oceanico Red Cave per trovare indizi sulla posizione di Mother. In una rovina sottomarina, l'androide custode Nadia dirige il gruppo di Shiki verso un indizio all'interno di una caverna vulcanica. Con il gruppo incapace di aggirare le fiamme della caverna, Witch persuade Laguna ad aiutare Shiki a trovare una via d'accesso sicura in cambio della possibilità di uscire dal Cosmo Sakura. L'indizio si rivela essere una Reliquia, un tesoro intriso dell'Etere di Mother, che consentirà all'equipaggio di individuare la posizione di quest'ultimo in modo più preciso raccogliendo l'Etere di altre Reliquie. Dopo aver aiutato Nadia a far fronte alla morte del suo amante umano, l'equipaggio segue l'Etere su un'altra Reliquia del pianeta Foresta, dove i robot hanno dominato la popolazione umana. Apprendendo dall'amico in visita di Rebecca, Couchpo, che Ziggy ha infettato i robot con un virus, l'equipaggio è costretto a combatterli per legittima difesa.