Sempre pronto a girare il mondo per portare a termine operazioni impossibili, Black Jack è un individuo misterioso e carismatico, tanto geniale quanto ribelle. Sebbene sia un medico qualificato, rifiuta di accettare una licenza medica a causa del suo odio e della sfiducia nei confronti dell’ipocrisia e della corruzione della comunità medica. Tra colpi di stato e rare malattie, però, anche il suo cuore di ghiaccio inizia a mostrare delle crepe… Soprattutto quando a finire sotto i ferri è Pinoko, la sua “assistente” che gli deve la vita.