Zetsu Nero spiega di aver nel corso degli anni manipolato gli eventi della storia dei ninja per permettere il ritorno di Kaguya. Questa affronta quindi Naruto e Sasuke, che hanno intenzione di usare i loro nuovi poteri per sigillarla. Per fermarli, Kaguya teletrasporta Sasuke in un'altra dimensione. Mentre Naruto affronta Kaguya da solo, Sakura e Obito vanno alla ricerca di Sasuke utilizzando il chakra della prima e la tecnica oculare del secondo. Anche se i due riescono a riportare Sasuke sul campo di battaglia, Obito muore nel tentativo di salvare il Team 7 da un attacco di Kaguya. Dopo aver ceduto il suo sogno di diventare Hokage a Naruto, Obito muore e si riunisce a Rin nell'aldilà, ma riesce comunque a passare il suo chakra a Kakashi, in modo che egli possa brevemente usare il suo Sharingan Ipnotico. Con l'aiuto di Kakashi e Sakura, Naruto e Sasuke riescono, infine, a sigillare Kaguya.