Jodie riflette sul cellulare di Conan toccato da Shuichi Akai quando il ragazzo lo fece cadere per farlo raccogliere ai sospetti infiltrati nell'ospedale centrale di Haido, ma viene interrotta dallo stesso Conan, che appare allarmato e non ne vuol dire il motivo ad Ai. Jodie chiede alla donna incinta moglie dell'uomo che aveva visto durante la rapina in banca se fu lei a tapparle gli occhi e la bocca, e lei conferma di averlo fatto sotto minaccia. La donna fa finta di sentirsi male e, cadendo su Jodie, le prende un oggetto dal braccio, quindi se ne va con il marito. Jodie chiama Camel, dicendogli che l'Akai sosia, visto ai grandi magazzini e alla rapina in banca, non era Akai, ma un membro dell'Organizzazione degli uomini in nero. Jodie, poi, tira fuori il biglietto con scritto "Scappa! Questa zona è pericolosa" che le era stato dato nel centro commerciale dove comparve il falso Akai, e non riesce più a spiegarsi chi e perché gliel'abbia mandato. Vedendola, Conan pensa "Mi scusi, agente Jodie!". Un uomo uguale a quello che diceva di essere stato preso in ostaggio durante la rapina in banca viene ritrovato svenuto, mentre lui e la donna incinta sono in un'auto. La donna dice di aver recuperato la microspia che lui aveva attaccato a Jodie, quindi i due si tolgono le maschere e rivelano di essere Vermouth e Amuro. Lui afferma di aver scoperto un segreto che non si aspettava, che lo rivelerà appena avrà prove certe e che Conan è "davvero terribile". Takagi rivela a Conan che la donna incinta non poteva essere colei che bendò Jodie durante la rapina, dal momento che i rapinatori scelsero le persone che erano da sole per far bendare gli altri e l'uomo è scapolo e non ricorda quanto successo al parco. Conan sospetta quindi che fossero Vermouth e Amuro, e che abbiano commesso un errore di proposito per studiare le sue prossime mosse. Mentre telefona ad Ai per chiederle se ha sentito la presenza dell'organizzazione, cosa che lei nega, Amuro lo sta spiando. Conan informa anche Jodie che i due coniugi potevano essere membri dell'organizzazione. Mentre cerca di risolvere un caso di omicidio, Sera telefona a qualcuno chiedendo un parere sulla propria deduzione, e Conan la vede. Dopo che Conan ha telefonato a Ran con la voce di Shinichi e rivelato la soluzione del caso, Sera si complimenta con lui come se sapesse che è stato lui a risolverlo. Eri Kisaki dice a Ran e Conan di aver sentito Sera parlare al telefono con qualcuno chiamandolo "fratello". Sera rivela poi di avere un secondo fratello: è il fratello di mezzo ed è simile al padre, quindi molto diverso da lei e il primo. Quest'ultimo le ha insegnato il Jeet Kune Do, mentre l'altro fratello non le fa sapere dove si trova perché sembra impegnato con un lavoro importante. Conan inizia a sospettare che Sera conosca la sua identità. La ragazza scrive al fratello con cui è in contatto che Conan sembra aver capito la soluzione di un caso, e quando il fratello le chiede di chi stia parlando, gli manda una foto del ragazzino chiedendogli se è sorpreso; il fratello risponde che non c'è problema. Sera non sa come faccia suo fratello a conoscere Conan, poi riceve da lui un altro messaggio, composto di una parte che non viene rivelata e dalla domanda "Sei già riuscita a incontrare il mago?"; lei pensa di sì.