Il membro dell'organizzazione, di nome Rikumichi Kusuda, sta cercando anch'egli Rena Mizunashi, ma si suicida mentre è inseguito da Akai. I membri dell'organizzazione si rendono conto che Rena Mizunashi è lì dato che si sono interrotti i contatti con il loro infiltrato. James e Jodie spiegano a Conan come Shuichi Akai si fosse infiltrato nell'organizzazione con il falso nome di Dai Moroboshi e il nome in codice di Rye, fidanzandosi con Akemi Miyano e venendo scoperto quando era stato programmato un incontro con il capo dell'organizzazione, a causa di un errore di un altro agente. Akai sta guardando l'ultimo messaggio di Akemi, con un post scriptum che non viene rivelato al lettore. Eisuke entra nella stanza di Rena Mizunashi e la costringe a muoversi minacciandola con delle forbici, e lei gli risponde in modo confidenziale. L'organizzazione crea il caos facendo sì che molte persone abbiano malori e vadano all'ospedale, e inviando lì molte bombe. Jodie e Andre Camel, altro agente dell'FBI, si sbarazzano di una bomba: lui le ruba il volante, ma rivela di averlo fatto solo perché conosceva un luogo utile per buttare la bomba nel fiume. L'FBI organizza un piano per portare via Rena Mizunashi dall'ospedale, utilizzando diversi furgoni, su uno dei quali ci sarà lei. Camel addormenta Jodie che voleva guidare il furgone con Rena Mizunashi al suo posto. Quando i due furgoni sono partiti, i membri dell'organizzazione scoprono quello con Rena Mizunashi e lo attaccano, riuscendo a recuperarla. Conan, Akai e Camel spiegano di aver volontariamente fatto sì che l'organizzazione riprendesse Rena e credesse morto Camel, in quanto lei è un'agente della CIA. La ragazza è in realtà la sorella di Eisuke, e il suo vero nome è Hidemi Hondo. Ha dato parte del suo midollo per salvare il fratellino dalla leucemia con un trapianto, cambiandogli così il gruppo sanguigno. Loro padre, Ethan Hondo, era un membro della CIA infiltrato nell'organizzazione, il quale si è sacrificato, decidendo di farsi uccidere dalla stessa figlia, in un momento in cui lei, che si era anch'essa infiltrata ma doveva uscire dall'organizzazione dopo poco tempo, rischiava di essere scoperta a parlare con lui di nascosto, a causa di un localizzatore nei suoi vestiti. In questo modo ha fatto sì che Hidemi continuasse la missione nell'organizzazione come spia al suo posto senza che gli uomini in nero sospettassero una relazione di parentela fra i due né che fossero infiltrati sotto copertura. Conan, Akai e Camel hanno quindi organizzato un piano per far tornare Hidemi nell'organizzazione come spia sia della CIA che dell'FBI. In seguito Camel viene coinvolto come sospettato in un caso di omicidio. Camel rivela a Jodie che è lui che con un errore ha fatto saltare la copertura di Akai, dicendo a un uomo anziano di allontanarsi dal luogo previsto per l'incontro con Gin, mentre il vecchietto era in realtà un membro dell'organizzazione. Una volta che Rena Mizunashi è tornata nell'organizzazione, Gin le riporta l'ordine del capo di uccidere, sparandogli con una pistola, Shuichi Akai, in modo da provare la sua fedeltà all'organizzazione. Perciò la notte stessa, ha luogo l'esecuzione: Kir e Akai si incontrano in un passo del valico Raiha e la donna gli spara a un polmone; Akai si stringe forte il petto iniziando ad ansimare.