A causa dei recenti e sempre più frequenti attacchi da parte di uno Yoma, un demone mutaforma, il consiglio di autogoverno di un villaggio si è trovato costretto a ricorrere ai servizi di una Claymore, una donna-guerriera dai poteri straordinari con caratteristiche per metà umane e per metà demoniache. Un giovane ragazzo di nome Raki fa subito amicizia con la Claymore inviata al villaggio, la quale gli salva la vita quando lo Yoma lo aggredisce. Raki viene esiliato dai suoi stessi concittadini a causa del fatto di essere l'ultimo superstite della famiglia al cui interno si era celato lo Yoma, ed in quanto tale si presume — secondo una falsa credenza — che anche lui possa presto trasformarvisi perché rimasto per molto tempo a stretto contatto col mostro. La Claymore, che si presenta come Claire, gli salva nuovamente la vita e acconsente, dopo molte insistenze da parte del ragazzo, a far viaggiare Raki insieme a lei; il ragazzo si prende l'incarico di cucinare i pasti per entrambi. In seguito Rubel, il supervisore di Claire e l'uomo che organizza le sue missioni e la tiene sotto stretta sorveglianza, le consegna un cartoncino nero e la Claymore si dirige ad incontrarne il proprietario: Elena. La collega di Claire si trova in uno stato vicino al "Risveglio" e, per evitare che la propria coscienza umana soccomba davanti alla natura demoniaca insita in lei, si fa uccidere da Claire.