Fujimaru Takagi, un formidabile hacker, viene coinvolto in un piano terroristico conosciuto con il nome di “Bloody Monday”, architettato da un losco figuro chiamato “K”. Mentre indaga per scoprire chi si nasconda dietro la cospirazione, il ragazzo viene a conoscenza della vera identità della provocante Maya Orihara, sedicente professoressa del suo liceo, e riesce a farla catturare e interrogare dall’Agenzia per la Pubblica Sicurezza. Nel frattempo, Fujimaru decodifica i due file ricevuti da suo padre, ottenendo così nuove, preziose prove che saranno fondamentali per sbrogliare l’intricata matassa degli eventi: vengono alla luce, infatti, strane similitudini con l’attacco terroristico che, due anni prima, aveva colpito la questura di Tokyo...