20th Century Boys # 1

Nel 1997 Kenji Endo, che gestisce con la madre un mini-market e accudisce Kana, la figlia neonata della sorella, viene avvicinato da due detective per il caso della sparizione di un suo cliente, il professor Shikishima. Andando a ritirare i vuoti, Kenji nota sulla parete dell'appartamento del professore il simbolo di una mano contenuta in un occhio, che gli sembra familiare.

Nel 1969 un gruppo di bambini composto da Kenji, Occio, Yoshitsune, Maruo, Yukiji e Donkey costruiscono un nascondiglio in un campo da utilizzare come base segreta e dove nascondersi per scambiarsi manga e riviste porno ed ascoltare la radio. Per celebrare l'evento Occio disegna un simbolo che rappresenti la loro amicizia, composto da un occhio ed una mano.
1997. Il corpo dello studente universitario Kaneda Shoutaro viene ritrovato misteriosamente dissanguato, e la polizia collega i due delitti.

1969. Kenji e i suoi amici iniziano a fantasticare su uno scenario apocalittico, in cui dei cattivi tentano di distruggere il mondo mentre loro tentano di fermarli, trascrivendolo in un libro che chiamano Libro delle profezie. Ascoltando alla radio i Rolling Stone, Kenia decise di prendere la sua prima chitarra mettendo da parte i soldi della sua paghetta.

Kenji viene a sapere da Maruo della morte di Donkey, il loro compagno d’infanzia. Donkey, che da ragazzino girava sempre con un asciugamano sporco di moccio, conquisto la fiducia di Kenji e gli altri quando un giorno li aiutò a togliersi dai guai in cui si erano cacciati. Kenji trova una lettera con il simbolo dell'occhio e della mano spedita da Donkey poco prima di morire.

Kenji e i suoi amici partecipano al funerale di Donkey venendo a sapere che il loro compagno di infanzia si è suicidato. I ragazzi ricordano di quando Donkey, per rimediare a una dimenticanza di un amico, si intrufolò di notte nell’aula di scienze della scuola.

Parlando con la vedova, Kenji scopre che Donkey aveva preso a cuore il caso di uno dei suoi studenti finito nel giro di una setta e in seguito trasferitosi all'università di Shikishima.

Kenji si mette alla ricerca dello studente di Donkey, un certo Tamura Masao, finendo per partecipare involontariamente a una partita di Softball.

Kenji riesce a contattare Tamura Masao, l’ex studente di Donkey, ma il giovane - membro di una setta che venera il misterioso "Amico" - non è intenzionato a parlare. Durante una serata, il gruppo di amici di Kenji si ricorda di aver seppellito qualcosa da bambini e scavando nel punto del loro nascondiglio di allora riportano alla luce alcuni loro ricordi, incluso il simbolo.

I ragazzi dissotterrano la scatola trovando al suo interno riviste porno, vecchi giocattoli e una bandiera stropicciata con il simbolo del gruppo. Nel frattempo il misterioso individuo che si fa chiamare “Amico0 viene acclamato come il salvatore.